Antiseptiklerin kullanım şekilleri çeşitlerine göre farklılık göstermektedir. İlk yardım esnasında ufak yaralarda antiseptik türlerinden olan batikon, ufak bir pamuğa bir miktar dökülerek yaranın etrafına gezdirilmektedir. Bunun yanında antiseptik yıkama ürünleri ile sadece tıbbi durumlarda el ve vücut temizliği doktor anlatımına göre kullanılmaktadır. Bir de tıbbi alanlarda çalışanlar, örneğin cerrahi işlem öncesinde cerrahlar ellerini ve kollarını üst düzeyde temizlik adına antiseptikleri gerekli yöntemlerle kullanmaktadır.